首爾市發表了「首爾市感染病應對綜合對策」，包括彌補在MERS善後過程中所出現的感染病應對限制、綜合改善公共保健醫療基礎設施與服務等內容的五大項、二十個課題。

首先，首爾市預計至2018年為止將市立醫院的負壓隔離病房數大幅增加至五倍以上，於6家醫院設置194間病房。為解決造成MERS擴散主要原因的急診室過密化、與呼吸道疾病患者長時間處於同一空間之問題等，至2017年為止，將於東部醫院、西南醫院等四家市立醫院急診室設置負壓設施。

而為了避免因探病而在醫院接觸確診患者，進而造成感染的問題發生，將在2017年前於7家醫院全新引進「獨立會客室」與「醫院出入管理系統」。

此外，於2015年11月19日出版了「首爾市MERS防疫對策白皮書」，書中詳細記載了MERS病情爆發當時的日期別主要狀況與防疫應對手段。